10月18日,国民政府派杜聿明为东北保安司令率军队前往接收。苏联红军承诺将苏军占领地交国民政府军接收,但暗中支持中国共产党派往东北的军队接收,拒绝国民政府军从大连登陆,因此中共军队获得进入东北的先机。因葫芦岛和营口地区已被中共军队控制,国民政府要求苏军掩护开往东北的国民政府军在此两处登陆,亦遭到苏军拒绝。于是国民政府军乃改从秦皇岛登陆,从山海关沿北宁路北进时经与中共军队作战而开入东北。1946年3月,熊式辉方进入锦州。
原定苏联红军攻占东北后3个月内撤军,后延至1946年3月苏联红军才开始从沈阳撤退,21日自长春撤退,4月25日撤出哈尔滨。3月12日,国民政府军进入沈阳。而早在1945年9月,中国共产党中央任命彭真为东北局书记,林彪为“东北民主联军”司令,调集大批干部和军队前往东北接收。东北民主联军控制了东北大片地区。在收复东北的过程中,中共领导的东北民主联军和国民政府军之间发生了争夺东北的激烈军事冲突。